Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms