Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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