Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms