Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms