Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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