Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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