Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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GPS1Q13098 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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GPS1Q13098 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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