Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRDM2Q13029 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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