Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PTPRJQ12913 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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