Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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