Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms