Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms