Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms