Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms