Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms