Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms