Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms