Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms