Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms