Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ID3Q02535 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ID3Q02535 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ID3Q02535 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms