Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms