Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms