Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX16P57768 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms