Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCR5P51681 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCR5P51681 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCR5P51681 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms