Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms