Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms