Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRT6CP48668 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT6CP48668 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms