Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP5P45974 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms