Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV3P41162 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
ETV3P41162 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV3P41162 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV3P41162 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms