Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL1P40616 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms