Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms