Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA5P28066 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms