Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DPA1P20036 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms