Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms