Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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