Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms