Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIG1P18858 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIG1P18858 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms