Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LBPP18428 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LBPP18428 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LBPP18428 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LBPP18428 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms