Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMP3P12645 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BMP3P12645 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms