Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DMDP11532 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DMDP11532 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DMDP11532 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DMDP11532 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DMDP11532 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DMDP11532 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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