Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSAP10619 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSAP10619 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSAP10619 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSAP10619 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSAP10619 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSAP10619 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSAP10619 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 370.7 ms