Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms