Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms