Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI1P08151 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI1P08151 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI1P08151 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI1P08151 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms