Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms