Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms