Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPLO60437 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPLO60437 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PPLO60437 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPLO60437 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPLO60437 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPLO60437 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPLO60437 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPLO60437 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPLO60437 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPLO60437 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPLO60437 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPLO60437 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPLO60437 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPLO60437 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms