Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms