Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ARHGEF9O43307 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ARHGEF9O43307 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARHGEF9O43307 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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