Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms